L'apparition d'Atlantis

Atlantis, ville sous-marine occupée pardes créatures semi-humaines, est découverte par les cassettes Décepticans Laserbeak et Buzzsaw. La confrontation entre les Décepticans et les êtres des profondeurs marines aboutit finalement à une alliance qui fournit aux Décepticans des cubes d'énergon et permet à l'Atlantide d'émerger à nouveau. Les Autobots Wheeljack, Brawn, Bumblebee sont envoyés pour étudier le problème, mais Wheeljack est capturé. Le roi d'Atlantide l'utilise pour mettre au point une arme qui paralyse les Autobots, et qui prive les Décepticans de presque toute leur mobilité. Les Décepticans en profitent pour semparer de Washington D.C. et Mégatron s'assoit sur le trône d'une statue. Les Autobots affrontent les Décepticans dans Washington, et l'aide des Dinobots leur procure l'avantage. Atlantis est finalement détruite dans une bataille finale où les Dinobots jouent un rôle très efficace de démolisseurs